데이터과학 삼학년

[Bigquery client] BQ client를 이용하여 dataframe 의 array 데이터 빅쿼리에 올리기 본문

GCP

[Bigquery client] BQ client를 이용하여 dataframe 의 array 데이터 빅쿼리에 올리기

Dan-k 2020. 8. 28. 21:41
반응형

제곧내

pandas 작업을 하다보면 한 column에 array형태가 들어가는 케이스가 있다.

이를 bigquery에 로드하면 bigquery는 array 자체를 string으로 받아 버리는 문제가 있다.

 

즉 내가 원하는 형태는 

이런 pandas dataframe 자료가 있을 때

 

 

이것을 Bigquery에 그냥 올리면 아래와 같이 string 형태로 올라가지만

 

 

실제 원하는 케이스는 아래 그림과 같을 것이다.

 

 

자 코드를 통해 어떻게 하는지 알아보자.

bigquery에 table을 load하기 위해서는 일단 bigquery client api를 사용한다.

from google.cloud import bigquery
import pandas
client = bigquery.Client()

## data
df = pd.DataFrame(
    {
        'my_string': ['a', 'b', 'c'],
        'my_int64': [1, 2, 3],
        'my_float64': [4.0, 5.0, 6.0],
        'my_array' : [[0.1, 2.1, 3.2],[2.3, 3.4, 5],[2.34, 4.2, 4.3]]
    }
)

 

 

ARRAY를 BQ 에 올리기 위해서는 schema 타입에 mode를 사용하여 mode가 REPEATED가 되게 해주어야한다

그러나, REPEATED를 사용할 경우 JSON 파일만 지원하기 때문에 data인 dataframe을 record 형태의 json 파일로 변형해 준다

def json_from_df(df):
    result = df.to_json(orient="records")
    parsed = json.loads(result)
    return parsed
    
data = json_from_df(df)
data
###
[{'my_string': 'a',
  'my_int64': 1,
  'my_float64': 4.0,
  'my_array': [0.1, 2.1, 3.2]},
 {'my_string': 'b',
  'my_int64': 2,
  'my_float64': 5.0,
  'my_array': [2.3, 3.4, 5]},
 {'my_string': 'c',
  'my_int64': 3,
  'my_float64': 6.0,
  'my_array': [2.34, 4.2, 4.3]}]

빅쿼리에 table을 로드하기 위해 스키마, append, replace 할지 등의 config 설정을 해준다

schema = [
    bigquery.SchemaField("my_string", "STRING"),
    bigquery.SchemaField("my_int64", "INTEGER"),
    bigquery.SchemaField("my_float64", "FLOAT"),
    bigquery.SchemaField("my_array", "FLOAT", mode="REPEATED")
]

job_config = bigquery.LoadJobConfig(schema=schema, write_disposition='WRITE_APPEND') # replace : WRITE_TRUNCATE

마지막으로 로드할 TABLE 위치 (프로젝트.데이터셋.테이블명)을 입력해주면 끝

bqclient.load_table_from_json(data, destination_table, job_config=job_config).result()

 

728x90
반응형
LIST
Comments